Jacques Mercier, a fait ses études au Conservatoire national supérieur de musique de Paris où il a obtenu un premier prix de direction d'orchestre à l'unanimité. La même année, il est Premier prix du Concours de Besançon et lauréat de la Fondation de la Vocation.
Jacques Mercier entame rapidement une carrière internationale. Qualifié de « Souveräner Dirigent » à Berlin, Jacques Mercier se produit également au Festival de Salzbourg.
De 1982 à 2002, Jacques Mercier est directeur artistique et chef permanent de l'Orchestre national d'Ile-de-France. Il développe une politique artistique exigeante récompensée par un hommage spécial lors des « Victoires de la Musique Classique » en 1995.
Durant sept années, Jacques Mercier a été Chef permanent du Turku Philharmonic en Finlande : une expérience déterminante dans son approche des œuvres des compositeurs du Nord de l'Europe comme Sibelius dont il s'attache à faire découvrir le répertoire en France. Dans le domaine de l'opéra, Jacques Mercier dirige tout particulièrement des œuvres issues du répertoire français : Carmen, Faust, Béatrice et Bénédict, Les Dialogues des Carmélites...
Pour le choix de ses enregistrements, Jacques Mercier fait preuve de curiosité. On lui a décern-é le Grand Prix de l'Académie Charles Cros pour Bacchus et Ariane d'Albert Roussel et le Prix de l'Académie du disque lyrique pour Djamileh de Bizet. Son dernier enregistrement Le Martyre de Saint-Sébastien de Claude Debussy a obtenu un « Choc » du Monde de la Musique. En 2002, Jacques Mercier a été élu « Personnalité musicale de l'année » par le Syndicat de la critique dramatique et musicale. En 2006, il assurera la direction artistique de l'Orchestre des Jeunes de la Méditerranée.